另外，存在于正常小腸上皮中的各種轉運系統、代謝酶等在Caco-2細胞中大都也有相同的表達，如細胞色素P450同工酶、谷氨酰胺轉肽酶、堿性磷酸酶、蔗糖酶、葡萄糖醛酸酶及糖、氨基酸、
二肽、維生素B12等多種主動轉運系統在Caco-2細胞中都有與小腸上皮細胞類似的表達。由于其含有各種胃腸道代謝酶，因此更接近藥物在人體內吸收的實際環境。
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